Jonathan es Director Ejecutivo de Jewish Voice Ministries International. Presenta un programa de televisión semanal llamado Jewish Voice with Jonathan Bernis, que se emite en todo Estados Unidos y en el extranjero. Conferenciante muy solicitado, Jonathan imparte clases en congresos y en iglesias locales de todo el mundo. Es un destacado líder del Movimiento Mesiánico. También es Presidente de Christian Alliance For Israel, un ministerio que organiza conferencias y seminarios pro-Israel para recabar el apoyo de los cristianos a Israel.